MODELO DE SOFTWARE SSD PARA DESENHO DE RNAS MULTIMÉRICOS

INTRODUÇÃO

Esta invenção consiste no software SSD, o qual incorpora a ferramenta de desenho de siRNA do software "Strand Analysis", dado que o desenho de shRNA multimérico requer sequências de siRNA como entrada. Assim, o software é também útil para o desenho e selecção de siRNA com base na termodinâmica de duplexes de siRNA Dessa maneira, para tornar o projeto do shRNA o mais simples possível, o SSD oferece uma opção integrada para gerar o modelo shRNA usando o RNA do mensageiro (mRNA) como entrada. Assim, conforme ilustrado na Figura abaixo, o SSD selecionará os três siRNAs mais funcionais e não sobrepostos para projetar os três shRNAs possíveis: monovalentes, bivalentes ou trivalentes.

DIFERENCIAL

O destaque deste software consiste na aplicabilidade com alto potencial de utilização, considerando que não há tecnologias concorrentes disponíveis, aumentando a disponibilização e a qualidade do produto. Por meio da utilização do software, há uma maior facilidade no desenho dos RNAs multiméricos em relação a desenhos manuais. Além disso, o software demanda apenas computadores simples, ou seja, sem grandes exigências, para ter uma boa performance.

Figura: Diagrama geral do software SSD para desenho de RNAs multiméricos, desde a entrada de dados até o resultado final, com arquivo exportável - BR512022002887-5

APLICAÇÕES E PÚBLICO-ALVO

A tecnologia pertence ao campo da Biologia, com aplicabilidade destinada a campos como Energia, Agropecuária e Alimentos. Ao incorporar a ferramenta “Strand Analysis”, o software é destinado para projetar e selecionar siRNA funcionais, O modelo de DNA projetado pelo SSD é adequado para a transcrição in vitro de círculos rolantes, resultando em várias cópias de shRNAs, fornecendo um método fácil e barato para produzir moléculas de RNAi em larga escala. Dessa maneira, esta invenção é destinada aos pesquisadores que tenham tais objetivos em mente.

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